O Instituto René Rachou (IRR/Fiocruz Minas) tradicionalmente é um polo muito importante do conhecimento científico em Minas Gerais e as plataformas de sequenciamento sempre contribuíram de forma integrada para fortalecer essa tradição, com equipamentos de última geração e corpo técnico qualificado. Uma das plataformas que engrandece esse trabalho é a plataforma Sanger do IRR, referência para toda rede.
Durante a pandemia de Covid-19, as plataformas precisaram passar por um momento de readaptação na prestação de serviço e assumir um papel importante na vigilância genômica do SARS-CoV-2. Durante algum tempo, a resposta foi dada pela Plataforma Sanger, fornecendo dados das sequências semanalmente para os serviços de vigilância epidemiológica. Após reestruturação e a contratação de profissional, a Plataforma de Sequenciamento NGS foi capaz de responder prontamente, por meio da Rede Genômica da Fiocruz.
A plataforma recebeu um robô pipetador, uma importante aquisição para aumentar a capacidade de processamento de amostras. O sequenciamento de genomas completos do SARS-CoV-2 foi iniciado no segundo semestre de 2021, quando os insumos foram recebidos e já foram submetidas mais de 1400 sequências no banco de dados GISAID. Todas as sequências passam por uma rigorosa avaliação e são submetidas apenas as sequências com elevado padrão de qualidade. Os números demonstram uma enorme eficiência, comprovando a dedicação dos profissionais envolvidos, como destaca o coordenador Pedro Augusto Alves.
“A pandemia da COVID-19 trouxe consigo vários desafios, impondo novos modelos de trabalho com o objetivo de minimizar os riscos de infecção. Sendo assim, o trabalho presencial para a geração de dados de vigilância genômica do SARS-CoV-2 tem sido de grande importância e só foi possível pelo grande envolvimento da equipe e pelo apoio constante da Rede Genômica da Fiocruz (http://www.genomahcov.fiocruz.br/a-rede/). A Rede tem sido um ótimo exemplo de como as Unidades da Fiocruz podem trabalhar em conjunto no combate a um grande problema de Saúde Pública e considero que este seja um importante legado. As estruturas da Rede de Plataformas da Fiocruz podem ser utilizadas no combate a outros problemas de Saúde Pública no Brasil, tendo em vista que as Unidades da Fiocruz estão localizadas estrategicamente no país.”
A produção de sequências tem aumentado ao longo dos meses, acompanhando o aumento do número de casos principalmente com o aparecimento das novas variantes. Além do sequenciamento em si, a plataforma conta com uma ótima relação com o LACEN-MG, hospitais e a Prefeitura Municipal de Belo Horizonte, o que é fundamental para o sucesso da vigilância genômica do SARS-CoV-2.
As plataformas de sequenciamento do IRR se mostram prontas para os desafios impostos no presente e se colocam como unidades estratégicas da Fiocruz para os desafios do futuro.